Hikâye, II. Dünya Savaşı’nın kaotik günlerinde başlar ve zayıf, hasta bir genç olan Steve Rogers’ın kahramana dönüşümünü anlatır. Asker olmak isteyen Steve, fiziksel yetersizliği nedeniyle defalarca reddedilir. Fakat kader ona bir şans verir: “Yetenekli Asker” programına katılma fırsatı doğar.
Dr. Abraham Erskine tarafından seçilen Steve, deneysel bir serum sayesinde süper insan güçlerine kavuşur ve böylece Kaptan Amerika kimliği doğar. Yeni yetenekleriyle sadece savaş alanında değil, aynı zamanda insanlığa karşı sorumluluk taşıyan bir lider olarak da şekillenir.
Steve’in karşısında, Red Skull vardır; Tesseract adlı güçlü ve mistik bir nesneye sahip olan Red Skull, dünyayı ele geçirmeyi hedeflemektedir. Kaptan Amerika, hem savaşta hem de arkadaşlarının desteğiyle mücadele ederken, gerçek dostluğun, cesaretin ve fedakârlığın anlamını derinlemesine öğrenir.